Vue d'ensemble
Ce qu'il faut savoir
- Le congé de longue durée est ouvert au fonctionnaire titulaire ou stagiaire, en activité ou en détachement, atteint de l'une des cinq affections ouvrant droit.
- Le CLD intervient à la fin de la 1re année de congé de longue maladie (CLM) rémunérée à plein traitement, ou directement si vos droits au CLM sont épuisés.
- Durée maximale : 5 ans, par périodes de 6 mois, et un seul CLD de 5 ans par catégorie d'affection sur toute la carrière.
- La mise en CLD suit un avis du conseil médical. Le renouvellement se demande directement, sans nouvelle saisine.
- Rémunération : 100 % pendant 3 ans, puis 50 % les 2 années suivantes pour le traitement indiciaire, la résidence et le SFT.
- Le CLD est sans effet sur l'avancement et ne réduit pas vos autres congés, mais il ne donne pas droit à des RTT.
Vérifier que votre affection ouvre droit au CLD
Deux conditions doivent être réunies : votre pathologie doit compter parmi les affections ouvrant droit, et elle doit vous empêcher d'exercer vos fonctions.
Cinq affections ouvrent droit au congé de longue durée, que vous soyez titulaire ou stagiaire, en activité ou en détachement.
La liste est fermée : aucune autre pathologie, aussi lourde soit-elle, ne donne accès au CLD par elle-même.
- Affection cancéreuse.
- Déficit immunitaire grave et acquis.
- Maladie mentale.
- Poliomyélite.
- Tuberculose.
Règle
Le CLD est attribué à la fin de la 1re année de congé de longue maladie rémunérée à plein traitement. Cette 1re année est considérée comme une période de CLD.
Si vous avez épuisé vos droits à l'année rémunérée à plein traitement d'un CLM, vous pouvez être placé directement en CLD.
Choisir entre le maintien en CLM et le passage au CLD
À la fin de la première année de CLM à plein traitement, deux voies s'offrent à vous, avec des effets différents sur vos droits ultérieurs.
L'administration accorde la prolongation de votre CLM ou un CLD, après avis du conseil médical.
La période de préparation au reclassement est distincte du CLD : elle sert à vous qualifier pour de nouvelles fonctions compatibles avec votre état de santé.
- Prolongation du CLM : vous y demeurez, mais un nouveau CLD pour la même pathologie devient bloqué.
- CLD : vous basculez dans son régime, avec sa durée maximale de 5 ans et sa rémunération propre.
- Point commun : demande à votre administration, appuyée d'un certificat médical, tranchée après avis du conseil médical.
Règle
Si vous obtenez la prolongation de votre CLM, vous ne pouvez plus bénéficier d'un CLD pour la même pathologie tant que vous n'avez pas repris vos fonctions au moins 1 an entre la fin du CLM et son début.
Le CLD peut aussi être mis en place à la demande de votre administration employeur, si une attestation médicale ou un rapport hiérarchique le justifie.
Adresser votre demande à votre administration
La demande est le point de départ de la procédure. Elle est simple, mais elle déclenche un calendrier et des droits précis.
Adressez à votre administration employeur une demande de CLD accompagnée d'un certificat médical d'un médecin.
Votre administration peut avoir mis en place un formulaire de demande de CLD. La fiche ne décrit pas de formulaire national imposé.
- Votre demande de CLD, adressée à votre administration employeur.
- Un certificat médical délivré par un médecin, attestant votre situation.
- Le formulaire de votre administration, s'il en existe un : renseignez-vous auprès de votre DRH.
- Le résumé d'observations de votre médecin, adressé directement au secrétariat du conseil médical.
Règle
Votre mise en CLD est prononcée après avis du conseil médical, qui transmet son avis à vous et à votre administration.
Le dossier médical vous incombe moins qu'il n'y paraît : votre médecin adresse directement au secrétariat du conseil médical le résumé de ses observations.
Faire instruire votre dossier par le conseil médical
Le conseil médical instruit, peut décider une expertise, puis rend un avis motivé.
Le conseil médical instruit le dossier et peut recourir à l'expertise d'un médecin agréé. Son avis conditionne la mise en CLD.
Un médecin agréé est un généraliste ou spécialiste figurant sur une liste établie par le préfet dans chaque département, sur proposition de l'ARS, après avis du Conseil départemental de l'ordre des médecins.
- Votre médecin transmet au secrétariat le résumé de ses observations et les justificatifs.
- Vous et votre administration pouvez faire entendre le médecin de votre choix.
- Le conseil médical peut, s'il le juge utile, demander à vous entendre.
- Le médecin du travail peut obtenir le dossier ou assister à la réunion sans voter.
- L'avis du conseil médical est motivé, dans le respect du secret médical.
Règle
La date de début de votre CLD est la date de la 1re constatation médicale de votre maladie : votre congé de longue maladie est requalifié en CLD.
L'administration dispose de 3 semaines pour transmettre votre demande. Passé ce délai, vous pouvez adresser un double par lettre recommandée avec avis de réception : cela vaut saisine.
Exercer vos droits avant la réunion
Entre la notification et la réunion, vous disposez d'un délai de consultation et de droits réels.
Le secrétariat vous informe de la date de la réunion au moins 10 jours ouvrés avant celle-ci, ainsi que de vos droits.
L'information porte sur la date d'examen de votre dossier, vos droits, et les voies de contestation devant le conseil médical supérieur.
- Consulter votre dossier, dont la partie médicale peut vous être communiquée à votre demande.
- Présenter des observations écrites et fournir des certificats médicaux.
- Être accompagné ou représenté à toutes les étapes par une personne de votre choix.
- Faire entendre le médecin de votre choix devant le conseil médical.
- Connaître les voies de contestation devant le conseil médical supérieur.
Règle
Vous êtes invité à consulter votre dossier dix jours au moins avant la réunion, personnellement ou par votre représentant.
Si vous demandez le CLD après avoir épuisé vos droits à congé de maladie, vous êtes provisoirement en disponibilité d'office pour raison de santé pendant la procédure, avec une indemnité égale au traitement indiciaire.
Demander le renouvellement de votre CLD
Une fois le CLD accordé, le renouvellement ne relève plus du conseil médical.
Le renouvellement est prononcé à votre demande, sans que le conseil médical soit saisi.
La demande doit être accompagnée d'un certificat médical de votre médecin indiquant que le congé accordé doit être prolongé, et précisant la durée de cette prolongation.
- Votre demande de renouvellement, adressée à votre administration.
- Le certificat médical de votre médecin, mentionnant la durée de la prolongation.
- L'examen par un médecin agréé, auquel l'administration vous soumet au moins 1 fois par an.
Règle
Si vous, ou votre administration, contestez l'avis du médecin agréé, vous pouvez saisir le conseil médical.
En cas de refus de votre part de vous soumettre à ces examens, votre rémunération n'est plus versée.
Vérifier la durée dont vous disposez
Le congé est plafonné, mais ce plafond se raisonne par catégorie d'affection et non par période de temps.
La durée maximale est fixée à 5 ans, utilisable de façon continue ou discontinue, par périodes de 6 mois.
Vous ne pouvez obtenir qu'un seul CLD de 5 ans par catégorie d'affection, au cours de votre carrière.
- Même catégorie : un nouveau CLD pour la même catégorie n'est possible que si vous n'avez pas épuisé le plafond de 5 ans.
- Nouvelle affection : si vous contractez une affection différente de celle qui a conduit à votre mise en CLD, vous avez droit à l'intégralité d'un nouveau CLD de 5 ans.
- Avancement : le temps passé en CLD est sans effet sur vos droits à l'avancement d'échelon et de grade.
Règle
Le CLD ne réduit pas vos droits aux autres congés. Si vous ne pouvez pas prendre vos congés annuels, une partie peut en être reportée, sous certaines conditions.
Les périodes de congé de longue durée ne vous donnent pas droit à des RTT.
Connaître les éléments de rémunération versés
Les trois fonctions publiques partagent le socle de rémunération. Elles divergent sur les primes et indemnités.
Traitement indiciaire à 100 % pendant 3 ans, puis 50 % les 2 années suivantes. Indemnité de résidence et SFT à 100 % pendant toute la durée du CLD.
Dans les trois fonctions publiques, la nouvelle bonification indiciaire (NBI) n'est plus versée pendant le CLD.
- État (FPE) : traitement, résidence et SFT aux taux ci-dessus ; primes et indemnités non versées.
- Territoriale (FPT) : mêmes conditions ; la suspension ou le maintien des primes est fixé par délibération.
- Hospitalière (FPH) : mêmes conditions, avec en plus l'indemnité de sujétion spéciale (ISS) à 100 % pendant 3 ans, puis 50 % les 2 années suivantes.
- Frais médicaux : honoraires des examens, du médecin agréé et frais de transport sont pris en charge par votre administration.
Règle
Si le CLD fait suite à une demande présentée pendant un CLM ou un congé de maladie, les primes et indemnités perçues pendant ce congé vous restent acquises.
Le transport est pris en charge sur justificatifs vérifiant qu'il est nécessaire et lié aux examens réalisés.
Connaître les effets sur votre carrière
Le CLD ne fige pas votre carrière et ne réduit pas vos autres droits — sauf les RTT.
Les périodes de CLD sont prises en compte pour la retraite, mais sans effet sur l'avancement d'échelon et de grade.
Pour la retraite anticipée carrière longue, les congés de maladie — maladie ordinaire, longue maladie, longue durée, citis — sont comptés dans la limite de 4 trimestres.
- Congés non réduits : congés annuels, maternité et adoption, 3 jours pour naissance ou adoption, paternité et accueil de l'enfant, congé supplémentaire de naissance.
- Congés non réduits, suite : formation professionnelle, solidarité familiale, proche aidant, acquis de l'expérience, bilan de compétences, formation syndicale, représentation d'une association, citoyenneté.
- Stagiaire : le congé de longue durée prolonge la durée de votre stage.
Règle
Vous pouvez demander une formation ou un bilan de compétences favorisant votre réadaptation ou reconversion. La demande est soumise à l'avis favorable du conseil médical ; l'administration se prononce dans un délai de 30 jours.
Si vous ne pouvez pas prendre vos congés annuels en raison du CLD, une partie peut en être reportée, sous certaines conditions.
Respecter vos obligations pendant le congé
Le congé de longue durée est un congé, pas une absence. Des obligations s'imposent pendant toute sa durée.
En cas de non-respect de ces obligations, votre rémunération n'est plus versée jusqu'à ce que vous respectiez l'obligation concernée.
Votre administration peut faire procéder au contrôle administratif de votre arrêt de travail par toute personne habilitée.
- Cesser tout travail rémunéré — sauf activités ordonnées et contrôlées médicalement en vue de votre réadaptation.
- Informer tout changement de domicile à votre administration.
- Signaler toute absence de plus de 2 semaines de votre domicile, sauf en cas d'hospitalisation, en indiquant dates et lieux de séjour.
- Vous soumettre aux visites médicales de contrôle.
Règle
Le contrôle porte sur votre présence à votre domicile, ou à votre lieu de repos s'il diffère, lorsque les sorties ne sont pas autorisées ou pendant les heures de présence obligatoire.
En cas d'absence injustifiée ou de refus de ce contrôle, la rémunération est interrompue jusqu'à la fin de l'arrêt de travail. Ces périodes comptent dans la période en cours.
Faire valider votre aptitude à la reprise
La fin du CLD ouvre une procédure de reprise, parfois soumise au conseil médical.
Pour reprendre vos fonctions à la fin de votre CLD, fournissez un certificat médical d'aptitude à la reprise.
L'avis favorable du conseil médical est requis après 5 ans de CLD, pour les fonctions exigeant des conditions de santé particulières, ou si le CLD a été demandé par l'administration.
- Certificat médical de votre médecin : il suffit à lui seul.
- Ou avis favorable du conseil médical, dans les trois cas ci-dessus.
- Adaptation du poste : votre poste peut éventuellement être adapté à votre état de santé.
- Disponibilité d'office provisoire le temps de la procédure, si la reprise est soumise au conseil médical.
Règle
Pendant la procédure, vous percevez une indemnité égale au traitement indiciaire et, éventuellement, aux primes perçues à la fin de la dernière période de CLM, jusqu'à la décision de reprise.
En cas de refus du ou des postes proposés sans motif valable lié à votre état de santé, vous pouvez être licencié après avis de la commission administrative paritaire.
Préparer la suite si vous ne pouvez pas reprendre
Si vous ne pouvez pas reprendre vos fonctions à la fin du CLD, votre situation est soumise au conseil médical. Le traitement diffère selon votre statut.
La solution dépend de votre statut : fonctionnaire titulaire ou fonctionnaire stagiaire.
La période de préparation au reclassement sert à vous qualifier pour de nouvelles fonctions compatibles avec votre état de santé.
- Titulaire : reclassement, préparation au reclassement, disponibilité d'office si l'état de santé peut évoluer favorablement, ou retraite pour invalidité — quel que soit votre âge — si vous êtes reconnu définitivement inapte à tout emploi.
- Stagiaire : congé non rémunéré d'un an renouvelable 2 fois, ou licenciement en cas d'impossibilité définitive et absolue de reprendre vos fonctions.
- Détaché pour stage et titulaire ailleurs : fin du détachement, remise à disposition de l'administration d'origine, examen selon les règles du titulaire.
Règle
Pendant toute la procédure, le maintien de la rémunération est assuré jusqu'à la décision. Si vous refusez l'expertise d'un médecin agréé, la rémunération cesse de vous être versée.
Deux formulations selon la fonction publique : indemnité égale au traitement indiciaire en FPE, maintien du demi-traitement en FPT et FPH. Vérifiez la vôtre auprès du service gestionnaire.
Textes applicables
- Code général de la fonction publique : articles L115-1 à L115-6Congés pour raison de santé et conseil médical.
- Code général de la fonction publique : articles L822-12 à L822-17CLD : conditions, durée et situations administratives.
- Code général de la fonction publique : articles L822-27 à L822-30Fin du CLD et disponibilité pour raison de santé.
- Décret n°86-442 du 14 mars 1986Médecins agréés, comités médicaux et congés de maladie (FPE).
- Décret n°87-602 du 30 juillet 1987Comités médicaux et congés de maladie (FPT).
- Décret n°88-386 du 19 avril 1988Aptitude physique et congés de maladie (FPH).
- Décret n°93-522 du 26 mars 1993 relatif aux conditions de mise en œuvre de la NBI dans la FPELégifrance
- Décret n°93-863 du 18 juin 1993 relatif aux conditions de mise en œuvre de la NBI dans la FPTLégifrance
- Décret n°94-139 du 14 février 1994 relatif aux conditions de mise en œuvre de la NBI dans la FPHLégifrance
- Décret n°2010-997 du 26 août 2010 relatif au régime de maintien des primes et indemnités des agents publics de l'État dans certaines situations de congésLégifrance
- Circulaire du 30 janvier 1989 relative à la protection sociale des fonctionnaires et stagiaires de l'État contre les risques de maladie et d'accidents de serviceLégifrance
- Circulaire du 22 mars 2011 relative au régime de maintien des primes et indemnités des agents publics de l'État dans certaines situations de congésLégifrance
Sources officielles
- OuvrirService-Public.fr
Congé de longue durée (CLD) du fonctionnaire
Vérifiée le 2026-10-04
Voir aussi
- Congé de longue maladie (CLM) du fonctionnaire
- Congé de maladie du fonctionnaire
- Congé pour invalidité temporaire imputable au service (CITIS) du fonctionnaire
Délais cités dans la fiche : 5 ans (durée maximale), 6 mois (période d'octroi), 3 ans puis 2 années suivantes (rémunération), 1 an (reprise avant un nouveau CLD), 10 jours ouvrés (réunion), 3 semaines (transmission), 1 fois par an (examen), 30 jours (formation), 2 semaines (absence), 4 trimestres (carrière longue).
